Podemos encontrar duas espécies de truta-de-rio. A espécie Salmo trutta trutta habita principalmente as barragens de Santa Luzia e o Rio de Unhais. Nos rios Ceira, de Unhais e na ribeira da Malhada do Rei pode ser encontrada a espécie Salmo trutta fário.

Salmo trutta trutta
Salmo trutta fario
A espécie Chondrostoma polylepis Steindachner, vulgarmente chamada Boga, tem uma distribuição relativamente elevada nas barragens do Alto Ceira e de Santa Luzia.

Chondrostoma polylepis Steindachner
As Barragens localizadas nas Serras da Pampilhosa e certos locais do Rio Zêzere são também habitados pela Carpa (Cyprinus carpio). Em Portugal, esta espécie existe em quase todas as bacias hidrográficas, à excepção das bacias a Norte do rio Douro.
Cyprinus carpio
O Achigã (Micropterus salmoides) encontra-se sobretudo na bacia hidrográgica do Tejo e a Sul desta. No entanto, na Barragem de S. Luzia e Alto Ceira atinge um elevado número de indivíduos.
Micropterus salmoides
Por fim, a espécie Anguilla anguilla, conhecida por enguia ou eiró, outrora muito comum no Rio Zêzere e praticamente em todos os outros rios, pode ser encontrada nas serras da Pampilhosa.
As enguias são peixes marinhos de profundidade, mas passam um período de crescimento em água salobra ou doce. Hoje, devido à má planificação das barragens construídas nas décadas de 40 e 50 do século passado, é mais rara.
Micropterus salmoides
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